Kluczowe zmiany w zakresie raportowania schematów podatkowych (MDR)

12 maja 2025 | Aktualności, Tax Focus, The Right Focus, Wiedza

Mocno zmieniające się realia prawno-podatkowe oraz rosnące oczekiwania w zakresie przejrzystości fiskalnej skłoniły ustawodawcę do wprowadzenia istotnych zmian w systemie raportowania schematów podatkowych. Zgodnie z ministerialnymi zapowiedziami, zasadniczym celem nowelizacji miało być uproszczenie dotychczasowych procedur.

Modyfikacje obejmują szereg kluczowych obszarów – od redefinicji pojęcia schematu podatkowego, poprzez zmiany w obowiązkach raportowych, aż po złagodzenie sankcji za uchybienia. Przyglądamy się najważniejszym kierunkom tych zmian i ich praktycznym konsekwencjom dla podatników oraz doradców podatkowych.

Nowe raportowanie MDR – czego możemy się spodziewać

Wśród najważniejszych zmian znalazło się wyłączenie schematów podatkowych z katalogu zagadnień, których może dotyczyć wniosek o wydanie interpretacji podatkowej.

W rezultacie schematy podatkowe mają nie być już przedmiotem indywidualnych interpretacji. Ministerstwo usprawiedliwia tę zmianę wskazując na kolizję pomiędzy dwiema odrębnymi procedurami: wydawaniem interpretacji podatkowych a nadawaniem numeru schematu podatkowego (NSP) przez Szefa KAS.

Dotychczas, jeśli podatnik najpierw uzyskał interpretację, a dopiero później wystąpił o NSP, to w praktyce jego interpretacja ograniczała możliwość niezależnej oceny schematu przez Szefa KAS w ramach procedury nadania NSP.

Nowelizacja usuwa definicję podmiotu „wspomagającego” i wprowadza jedno pojęcie „promotora”. Przewiduje także generalny obowiązek przekazywania informacji o zastosowaniu schematu podatkowego (informacji MDR-3) tylko raz na rok, co w połączeniu z możliwością wskazania szacunkowej wysokości korzyści podatkowej ma uprościć całą procedurę.

Ponadto, nowe przepisy pozwalają, żeby informacje te były podpisywane przez pełnomocników, co w praktyce oznacza, że podatnicy będą mogli scedować ten obowiązek na swoich doradców podatkowych.

Kolejną zmianą jest dostosowanie definicji schematów podatkowych do pojęciowego zakresu określonego w Dyrektywie 2018/822, w tym zmodyfikowanie katalogów poszczególnych cech rozpoznawczych. Ministerstwo Finansów zapowiadało prawdziwą rewolucję w tym zakresie, która miała prowadzić do znaczącego zmniejszenia liczby cech rozpoznawczych. W praktyce jednak planowana nowelizacja w obecnym kształcie nie odzwierciedla tych zapowiedzi.

Przykładem zaplanowanych modyfikacji jest zmiana jednej ze szczególnych cech rozpoznawczych wymienionych w art. 86a § 1 pkt 13 lit. c) Ordynacji podatkowej (w projektowanej wersji art. 86a § 2 pkt 9 lit. d), tj. korzystania przez ten sam dochód lub majątek z metod mających na celu unikanie podwójnego opodatkowania w więcej niż jednym państwie.

Nowelizacja polega doprecyzowaniu obowiązku zgłaszania schematów podatkowych w sytuacji, gdy podmiot czerpie korzyści z ulg lub zwolnień w zakresie dochodu bądź majątku, mających na celu unikanie podwójnego opodatkowania w więcej niż jednym kraju (poprzez dodanie odniesienia do „ulg” i „zwolnień”.)

Celem tych zmian mają być bardziej klarowne i jednoznaczne kryteria rozpoznawania schematów podatkowych, co w założeniu ma ułatwić ich identyfikację i raportowanie.

W praktyce jednak planowane przepisy, zamiast ograniczyć liczbę cech rozpoznawczych wprowadzają dodatkowe, liczne kryteria – np. w projektowanym przepisie art. 86a § 2 pkt 9 lit. f) szczególna cecha rozpoznawcza polegająca na możliwym skutku obejścia obowiązku raportowania wynikającego z przepisów o wymianie informacji podatkowych została poszerzona o 6 dodatkowych, rozbudowanych przesłanek.

Zmiany obejmą także korekty w zakresie przepisów dotyczących sankcji za niewykonanie obowiązków związanych z raportowaniem MDR m.in. poprzez złagodzenie kar za uchylanie się od obowiązków z 720 do 240 stawek dziennych (z maksymalnej kary  44.792.640 zł, która jest jedną z najwyższych w UE do około 10 mln zł).

Krajowe schematy podatkowe MDR

Nowelizacja wprowadza także zmiany w zakresie raportowania krajowych schematów podatkowych.

Podmioty zobowiązane do raportowania nie będą musiały ponownie przekazywać informacji o uzgodnieniach, które zostały już zgłoszone w ramach innych obowiązków, takich jak informacje o cenach transferowych (TPR) czy informacje sporządzane dla nierezydentów.

Takie rozwiązanie rzeczywiście ograniczy dublowanie zgłoszeń oraz pozwoli na pewne uproszczenie procesów administracyjnych.

Z drugiej strony, skutkiem tych zmian jest także możliwość wydania przez Ministra Finansów rozporządzenia wyłączającego z obowiązku raportowania tych schematów, które spełniają cechy rozpoznawcze, ale ze względu na swoją specyfikę nie powinny podlegać zgłoszeniu do szefa Krajowej Administracji Skarbowej.

To rozwiązanie wydaje się być najdalej idącym krokiem w stronę spełnienia obietnic Ministerstwa Finansów dotyczących zmniejszenia obowiązku raportowania schematów krajowych.

Jak podkreślił wiceminister resortu, przewiduje się, że po nowelizacji liczba zgłoszeń MDR-3 odnoszących się do wdrożonych działań zmniejszy się o 90 proc., czyli z obecnych 15 tysięcy spadnie do około 1,5 tysiąca.

Ewolucja w zakresie MDR

Obecne przepisy w zakresie raportowania schematów podatkowych poprzez swoją złożoność, rozbudowanie i brak precyzyjności niejednokrotnie nie pozwalają na jednoznaczne określenie, kto i w jakim zakresie ponosi odpowiedzialność za wypełnianie obowiązków raportowych.

Planowane zmiany mają jednak charakter głównie formalny i wbrew zapowiedziom nie stanowią rewolucji w tym obszarze. Modyfikacje w założeniu mają porządkować dotychczasowe przepisy i eliminować niektóre niejasności proceduralne, aby zwiększyć przejrzystość oraz spójność systemu raportowania. W praktyce jednak prowadzą do poszerzenia zakresów pojęciowych przesłanek raportowania i wprowadzają nowe rozwiązania proceduralne (możliwość wydania przez Ministra Finansów rozporządzenia wyłączającego z obowiązku raportowania schematów).

Co jednak najważniejsze, wiele przepisów, które mają wpływ na zakres obowiązków podatników uległo modyfikacji. Dlatego warto odpowiednio się do nich przygotować. Zwłaszcza pod kątem wdrożenia nowych procedur wewnętrznych, przypisania odpowiednich obowiązków pracownikom oraz ewentualnego dostosowania dotychczasowych schematów działania.

Jednym zdaniem – uproszczenia miały być większe niż są, ale ponieważ dochodzi do istotnej przebudowy całego  systemu raportowania, należy gruntownie się do tego przygotować.

Masz pytania? Skontaktuj się  z nami

Agata Dziwisz-Moshe

Najnowsza Wiedza

Przegląd sektora bankowego | Banking dziś i jutro | Maj 2026

„Koniec snu o darmowych mieszkaniach” – tak Związek Banków Polskich ocenia czwartkowe orzeczenia Trybunału Sprawiedliwości Unii Europejskiej w sprawach dotyczących tego, czy przedawnienia instytucji finansowych wobec frankowiczów się przedawniły.

Kaucja jak VAT? System kaucyjny i ryzyko, którego nikt nie chce głośno nazwać

System kaucyjny miał być prosty. Ekologiczny. Szczelny. Neutralny podatkowo. Kilka miesięcy wystarczyło, żeby zacząć mieć poważne wątpliwości. Pierwsze luki nie są już teorią, bo widać je gołym okiem. Mechanizmy nadużyć można opisać całkiem precyzyjnie, a skala potencjalnych strat może okazać się znacznie większa, niż ktokolwiek przewidywał. Poniżej sprawdzamy, gdzie system traci kontrolę i co z tym można zrobić.

NZIA „Made in Europe” staje się warunkiem gry rynkowej w energetyce

Unia Europejska przyjęła strategiczny kurs na budowę własnych mocy produkcyjnych w obszarze kluczowych technologii, w tym technologii energetycznych. Wyrazem tej polityki jest rozporządzenie o przemyśle neutralnym emisyjnie (NZIA – Net-Zero Industry Act), które redefiniuje zasady konkurencyjności m.in. w sektorze odnawialnych źródeł energii. W przetargach, aukcjach i programach wsparcia publicznego cena przestaje być jedynym kryterium wyboru dostawcy. NZIA nakłada na instytucje zamawiające i podmioty zarządzające systemami wsparcia obowiązek oceniania ofert również pod kątem pochodzenia technologii oraz innych wskazanych w rozporządzeniu kryteriów. Zmiana ta ma charakter systemowy i dotknie wszystkich uczestników rynku, zarówno producentów, jak i nabywców technologii energetycznych. W niniejszym materiale analizuję, w jaki sposób nowe regulacje unijne przełożą się na praktykę biznesową przedsiębiorstw działających na rynku europejskim.

WHT – Obowiązek weryfikacji statusu beneficial owner przy wypłacie dywidendy. Interpretacja Dyrektora KIS vs objaśnienia Ministra Finansów

Polska spółka wypłacająca dywidendę do zagranicznej spółki-matki z siedzibą w Unii Europejskiej może skorzystać ze zwolnienia z podatku u źródła (WHT). Czy w ramach weryfikacji prawa do tego zwolnienia spółka musi sprawdzać, czy odbiorca dywidendy jest jej rzeczywistym właścicielem (beneficial owner, BO)? Okazuje się, że Dyrektor Krajowej Izby Skarbowej i Minister Finansów mają na to pytanie dwie, zupełnie różne odpowiedzi. Co to oznacza w praktyce? Sprawdzamy.

Bankowość 2026 – technologia, regulacje i nowy krajobraz rynku

2026 przyniesie sektorowi bankowemu najbardziej dynamiczną transformację od dekady. Trendy zidentyfikowane w raporcie Accenture Top Banking Trends FY26 wskazują, że sektor wchodzi w fazę, w której technologia i regulacje stworzą nierozerwalny duet napędzający wszystkie kierunki zmian. Ale to właśnie regulacje wyznaczają granice, tempo i sposób implementacji nowych rozwiązań. Sprawdzamy, na co jeszcze zwracają uwagę eksperci.

Pułapka pierwszego roku – rozliczenie poziomu selektywnego zbierania w systemie kaucyjnym za 2025 r.

System kaucyjny zaczął funkcjonować 1 października 2025 r. Część przedsiębiorców przystąpiła do niego od razu, a część zdecydowała się na dołączenie później. Na pierwszy rzut oka może to wydawać się jedynie kwestią organizacyjną. W praktyce jednak moment przystąpienia do systemu może mieć istotny wpływ na wynik rozliczenia poziomu selektywnego zbierania za 2025 r.

Zapraszamy do kontaktu:

Agata Dziwisz-Moshe

Agata Dziwisz-Moshe

Adwokat / Partner / Szefowa Praktyki Prawa Podatkowego

+48 668 886 370

a.dziwisz@kochanski.pl